Olá Raul,
Para utilizar o Leitor de Código de Barras, no geral, não exige nenhuma parametrização, basta apenas instalar o Leitor na máquina desejada e, para utilizar, basta abrir o Lançamento Financeiro no RM Fluxus, na aba [integração Bancária] e colocar o cursor no Campo 'Código de Barras' ou 'Linha Digitável (IPTE)' e passar o Leitor sobre o bocumento impresso (boleto) a ser pago.