Rogério,
Se não foi integrado ao lote zero, basta excluir a contabilidade e gerar novamente. Se não estiver aparecendo a opção de Excluir Contabilidade em Processos é porque nos parametros do tipo de movimento está marcado a opção Contabilização Obrigatória. Basta acessar os parametros do tipo de movimento, desmarcar a opção Contabilização Obrigatória, Excluir a Contabilidade dos movimentos e contabilizar novamente.
Abrçs.