Neto,
Meio tarde a resposta, mas vamos lá.
Existe um programa conversor do Classis para o Totvs Educacional. Peça para o suporte da TOTVS que te enviam.
Em nossos testes, está funcionando, mas a cada conversão que realizamos, encontramos informações a serem corrigidas no Classis.
Agora estamos em fase final dessas atualizações, arrumando todas as informações do Classis para ficar redondo e depois converter e desativar o Classis definitivamente.
Att,
Rafael!